Sanktuarium Matki Bożej Kazimierskiej zostało ufundowane w 1589 r., na wzgórzu „Plebania Górna” w Kazimierzu Dolnym dla upamiętnienia pierwotnego właściciela terenu – proboszcza kazimierskiej fary. Wybór miejsca, na którym znajduje się kościół nie był przypadkowy ponieważ wzgórze to od lat stanowiło miejsce pielgrzymek.
W 1688 wybudowano schody do kaplicy, a w latach 1705-1708 Sanktuarium Matki Bożej Kazimierskiej zostało otoczone murem. Sam ołtarz główny powstał w 1770 r. według projektu architekta Tomasza Hoffmana, a obecnie znajduje się przy nim obraz z 1600 r. Zwiastowania Najświętszej Maryi Panny. Specjalna komisja biskupia uznała obraz za „łaskami i cudami słynący, ozdobiony wieloma wotami ze złota i srebra”. Wota – przeszło 38 funtów złota i srebra – świątobliwi mnisi przeznaczyli na ocalenie Najjaśniejszej Rzeczypospolitej w czasie insurekcji kościuszkowskiej.